一、休斯顿有55所大学和学院，其中最著名的是休斯敦大学和莱斯大学。 其他还有少许知名度的学校有：
1、University of Houston–Clear Lake ("UHCL")；
2、University of Houston–Downtown ("UHD")；
3、Texas Southern University ("TSU")；
4、University of St. Thomas；
5、Houston BAptist University；
二、休斯顿大学：
1、休斯顿大学坐落在休斯顿市中心休斯顿大学，1927年建校，是美国第四大城市休斯顿市最具活力的公立大学，有75年历史，在教学和研究方面是德州最好的大学之一。该校研究多样性，著称于全美。
2、休斯敦大学属于研究型大学〈research university〉。每年注册的学生中有21%是研究生，而这些学生中有33%接受休斯敦大学的奖学金资助。在这些研究生中，除了商学院、MBA是受学生青睐的热门科系外，因为邻近计算机大厂，使得该校的信息科学的相关科系排名也居高不下。
3、休斯顿大学有12个学术学院，分别是：建筑学院，商学院，文学与社会科学学院，教育学院，工程学院，技术学院，自然科学与数学学院休斯顿大学，制药学院，光学学院，酒店管理学院，法学院，社会工作研究生院。大学的课程涵盖278个学科。因教学质量高，休斯顿大学本科教育生源优异，入学sat成绩平均为1281。在研究生教育阶段，休斯顿大学重视对学生独立研究能力的培养。
4、休斯顿大学设有40余个研究中心，并与300余家政府和个人企业建立合作关系，为学生提供诸多实习机会，在超导电性，生物医学工程，经济，教育，石油勘探，虚拟技术方面取得很大成效。因为休斯敦大学的学生多半可以获得很好的实习机会，并有机会申请各种的奖助学金，因此能比其他大学的学生更快地进入社会，体验工作和生活的乐趣。
三、莱斯大学：
1、作为休斯顿乃至德克萨斯州的最高学府, 位于宁静的休斯敦市郊的莱斯大学（Rice University）在1892年由得克萨斯州棉花巨富威廉·马歇尔·莱斯William Marshall Rice，并且与其它两所，北卡罗来纳州的杜克大学Duke University、维吉尼亚州的维吉尼亚大学University of Virginia齐名，号称为南方哈佛The Harvard of the South， 为美国南方最高学府，离市中心仅三里车程。 作为美国的老牌名校，以工程系闻名的莱斯大学在以往至今的US News & World Report的美国大学综合排名中一直处于前20的位置，在20世纪90年代一度位于综合排名的前十位，在US NEWS 最新排名中居第17位。此外，在2008年版《普林斯顿评论》中，莱斯大学在“最佳价值”私立大学中位列第一。 在多种世界大学综合排名中，莱斯大学也常年处于世界前列，在2011-2012年荷兰莱顿大学世界大学100强排名中，莱斯大学更是位列全球第四名，也说明了莱斯大学优秀的国际声誉。
2、莱斯大学博采众长，集“好大学”该有的特点于一身。100多年前得克萨斯棉花巨富威廉·马歇尔·莱斯（William Marshall Rice）建校时，在学术上以治学严谨的普林斯顿大学作模范；在宿舍管理系统上则是效仿英国牛津大学的“住宿学院制”；在建筑风格上，许多学生说校园内笔直参天的橡树、石子小径和西班牙地中海式的房屋，都使他们想起斯坦福大学；而在价格上，莱斯大学则更像美国的一般公立大学。 莱斯大学很小的学生规模和巨额的校友捐助也成为了它之所以能够提供较为廉价的高水平教育的原因。作为私立大学的莱斯大学也和作为公立大学的休斯顿大学成为了休斯顿最重要的两所高等学府。