《VASP使用总结》word版 本文关键词：VASP，word
《VASP使用总结》word版 本文简介：VASP计算的理论及实践总结一、赝势的选取二、收敛测试1、VASP测试截断能和K点2、MS测试三、结构弛豫四、VASP的使用流程（计算性质）1、VASP的四个输入文件的设置2、输出文件的查看及指令3、计算单电能(1)测试截断能(2)测试K点4、进行结构优化5、计算弹性常数6、一些常用指令一、赝势的选
《VASP使用总结》word版 本文内容：
VASP计算的理论及实践总结
一、赝势的选取
二、收敛测试
1、VASP测试截断能和K
点
2、MS测试
三、结构弛豫
四、VASP的使用流程（计算性质）
1、VASP的四个输入文件的设置
2、输出文件的查看及指令
3、计算单电能
(1)
测试截断能
(2)
测试K点
4、进行结构优化
5、计算弹性常数
6、一些常用指令
一、赝势的选取
VASP赝势库中分为：PP和PAW两种势，PP又分为SP（标准）和USPP（超软）。
交换关联函数分为：LDA（局域密度近似）和GGA（广义梯度近似）。GGA又分为PW91和PBE。
在VASP中，其中pot,pot-gga是属于超软势（使用较少）。Paw,paw-pbe,和paw-gga是属于PAW。采用较多的是PAW-pbe
和PAW-gga。
此外vasp
中的赝势分为几种，包扩标准赝势(没有下标的)、还有硬（harder）赝势(_h)、软（softer）赝势(_s),所谓的硬（难以赝化），就是指该元素原子的截断动能比较大，假想的势能与实际比较接近，计算得到的结果准确，但比较耗时，难以收敛。软（容易赝化），表示该元素原子的截断动能比较小，赝势模型比较粗糙，但相对简单，可以使计算很快收敛（比如VASP开发的超软赝势）。即硬的赝势精度高，但计算耗时。软的精度低，容易收敛，但节省计算时间。
另一种情况：如Gd_3，这是把f电子放入核内处理，对于Gd来说，f电子恰好半满。所以把f电子作为价电子处理的赝势还是蛮好的（类似还有Lu，全满）。（相对其他的4f元素来说，至于把f电子作为芯内处理，是以前对4f元素的通用做法。计算结果挺好）
常用的做法是：用两种赝势测试一下对自己所关心的问题的影响情况。在影响不大的情况下，选用不含4f电子的赝势（即后缀是3），一来减少计算量，二来避免DFT对4f电子的处理。
【1.赝势的选择：
vasp的赝势文件放在目录
~/vasp/potentials
下，可以看到该目录又包含五个子目录
pot
pot_GGA
potpaw
potpaw_GGA
potpaw_PBE
，其中每一个子目录对应一种赝势形式。
赝势按产生方法可以分为PP
(standard
pesudopotential，其中大部分是USPP,ultrasoft
pesudopotential)
和
PAW
(projector
augmented
wave
method)。按交换关联函数的不同又可以有
LDA
(local
density
approximation)
和
GGA
(generalized
gradient
approximation)，其中GGA之下又可以再分为PW91和PBE。
以上各个目录对应起来分别是
pot
==>
PP,LDA
;
pot_GGA
==>
PP,GGA
;
potpaw
==>
PAW,LDA
;
potpaw_GGA
==>
PAW,GGA,PW91
;
potpaw_PBE
==>
PAW,GGA,PBE。选择某个目录进去，我们还会发现对应每种元素往往还会有多种赝势存在。这是因为根据对截断能量的选取不同还可以分为
Ga,Ga_s,Ga_h，或者根据半芯态的不同还可以分为Ga,Ga_sv,Ga_pv的不同。
一般推荐选取PAW_PBE。其中各个元素具体推荐哪种形式的赝势可以参考vasp
workshop中有关赝势部分的ppt。当然自己能测试之后在选择是最好不过的了，以后再聊。
2.POTCAR的建立：
选好哪一种赝势之后，进入对应的目录，你会看到里边有这么几个文件，POTCAR.Z
PSCTR.Z
V_RHFIN.Z
WS_FTP.LOG
。我们需要的是第一个。把它解压，如
zcat
POTCAR.Z
>
Ga
。对As元素我们也可以类似得到一个As文件。用
cp
命令或者
mv
命令把这两个文件都移到我们的工作目录里。然后再用
cat
命令把这两个文件合并在一起，如
cat
Ga
As
>
POTCAR
，这样就得到了我们需要的POTCAR。同理，有多个元素的POTCAR也可以这样产生。这里需要注意的是，记住元素的排列顺序，以后在POSCAR里各个元素的排列就是按着这里来的。http://emuch.net/html/201108/3452012.html】
二、收敛测试
1、VASP测试
计算的参数，比如k-points或cutoff，肯定是取的越多越准确，但相对的计算量就会增加，为了既保证计算的精确度，又尽可能的减少计算量，所以进行收敛测试，比较不同的参数，所得的两者的差值，差值符合误差的范围，就认为已经收敛。
VASP中收敛测试主要是测试截断能和K点，（注意：按照经验，先优化K点，且根据manu，K
Ce回车，
ls
就会发现已将所需的势解压出来了，
第二步：就是将解压出来的各元素的势都添加到POTCAR中，步骤如下：
cat空Ce空Co空B空Si空>POTCAR回车（注意这里边各元素的添加顺序一定要与POSCAR中的一致，如图所示），ls发现已经出现了POTCAR这个文件夹。
（3）KPOINTS
KPOINTS是设置最简单的，只需要在原来的文件中修改K点网格数就可以了，这个根据计算的实际情况而定。(一般可以依据MS中的调整来设置不同的K点)如下为该文件：
（4）INCAR
INCAR是一个非常重要的输入文件，也是最难设置的。如图所示，第一行不System不重要，只是一个名称。
ISTART
=0是指开始新的计算；ICHARG
=2是指从原子的电荷密度重叠构造初始电荷密度
ISMEAR
=0是指采用高斯方法；SGIMA=0.1是指展宽为0.1eV
ECUT
=380
是指平面波的截断能为380
IBRION
=6;
(等于6时是计算弹性性质；等于2时是在优化)；ISIF=3是有化参数（大于等于3时是计算弹性性质）；NSW=15是计算的步数
EDIFF和
EDIFFG是电子和离子收敛精度
PREC=
Accurate是计算精度（对应MS中coarse、medium、fine等）
因次，INCAR中的参数需要根据实际情况来设置，在这里也不便多说。
2、输出文件的查看和指令
输出文件有CONTCAR、OUTCAR、comment等。
查看输出文件less（不在界面显示结果，看完了输入:wq或者:q回车就退出了）
用cat查看时（会将结果显示在界面）
CONTCAR文件主要是优化完的结果文件（就是将CONTCAR文件改为POSCAR文件进行下一步计算）
Comment文件主要是查看一次性测试完截断能的结果文件。
OUTCAR文件包含VASP计算的绝大部分结果文件。
查看所计算体系的体积时，使用命令：grep
空”volume”
空OUTCAR回车
查看所计算体系的总能时，使用命令：grep
空“TOTEN”
空OUTCAR空|tail空-n空1回车，如图所示
若是是用脚本测试截断能，则在comment中查看结果，即：
cat空comment回车，如下图所示
查看弹性常数时：
第一种：可以用脚本来提取（即在计算的文件夹下放入提取弹性常数的脚本get-elastics.sh
，待计算完毕的时候，输入sh空get-elastics.sh
，在界面上就出现结果了。
第二种：第一步：grep空ELA空OUTCAR回车
第二步：cat空-n空OUTCAR空|grep空“TOTAL
ELASTIC
MODULI”(将界面上出现的结果文件粘贴到这儿)回车（就会显示一些有代码的结果文件）,如：473711（矩阵行列起始）及文件名
第三步：sed空-n空“473711，473731”（弹性常数所处的行数）空
（就会显示出弹性常数）回车
3、计算单点能
计算单点能通常是用来测试ENCUT
和K点的
（1）测试截断能
第一种方法：POSCAR
POTCAR
都比较简单，就是按照前面所说的方法步骤弄就可以了（注意POTCAR中添加势的时候要与POSCAR中的元素顺序一致）。
最重要的是INCAR和
KPOINTS中参数的设置：
SYSTEM
=
tetr
Nd_Si
ENCUT
=
300
ISTART
=
0;
ICHARG
=
2
ISMEAR
=
0;
SIGMA
=
0.1
#IBRION
=
2;
ISIF=3
;
NSW=15
EDIFF
=
0.1E-04
EDIFFG
=
-1E-3
PREC
=
Accurate
以上是INCAR中的参数设置，对于计算单点能时，只需要将ENCUT设置一下，#IBRION
=
2;
ISIF=3
;
NSW=15（这一行标注了意思就是取默认值），对于KPOINTS则只需要设置K点网格就可以了。
设置好之后，先按退出键ESC
→→
输入:wq回车，就是保存并退出
运行指令：/opt/mpi/openmpi/1.6.5/bin/mpirun空
–n空10空vasp空>vasp.out空
ICHARG
=
2
ISMEAR
=
0;
SIGMA
=
0.1
#IBRION
=
2;
ISIF=3
;
NSW=15（要用#号标注，意思是采用默认值）
EDIFF
=
0.1E-04
EDIFFG
=
-1E-3
PREC
=
Accurate
然后就设置不同的k点网格，设置好之后，先按退出键ESC
→→
输入:wq回车，就是保存并退出
然后进行计算就OK了，运行指令：/opt/mpi/openmpi/1.6.5/bin/mpirun空
–n空10空vasp空>vasp.out空
ISIF=3
，其他的取默认值即可。
SYSTEM
=
tetr
Nd_Si
ENCUT
=
300（改为测试出来的）
ISTART
=
0;
ICHARG
=
2
ISMEAR
=
0;
SIGMA
=
0.1
IBRION
=
2;
ISIF=3
;
NSW=15（将这一行的标注#去掉，并设为IBRION
=
2;
ISIF=3
，）
EDIFF
=
0.1E-04
EDIFFG
=
-1E-3
设置好之后，先按退出键ESC
→→
输入:wq回车，就是保存并退出
然后就可以运行了，运行指令：/opt/mpi/openmpi/1.6.5/bin/mpirun空
–n空10空vasp空>vasp.out空
ICHARG
=
2
ISMEAR
=
0;
SIGMA
=
0.1
ENCUT
=
380
IBRION
=
6;
ISIF
=
3;
NSW
=
15（算弹性常数时，IBRION
=
6;
ISIF
=
3）
EDIFF
=
0.1E-04
EDIFFG
=
-1E-3
PREC
=
Accurate
设置好之后，先按退出键ESC
→→
输入:wq回车，就是保存并退出。若是不保存只是退出为”:q”,强制退出“:q!”.
此时就可以进行运算了，运行指令：/opt/mpi/openmpi/1.6.5/bin/mpirun空
–n空10空vasp空>vasp.out空第三步，进行计算其他的性质。
这就是第一性原理的方法，VASP计算也是同样的步骤。
篇2：主题党日活动总结
主题党日活动总结 本文关键词：活动总结，主题
主题党日活动总结 本文简介：开展“喜迎十九大、党员当先锋”主题党日活动总结今年是中国共产党建党96周年，也是十九大召开之年，更是深入推进党的建设的重要一年，为进一步增强党组织生活的吸引力，充分发挥基层党组织在党员教育、管理和服务中的作用，开展“喜迎十九大、党员当先锋”主题党日活动。一、总体情况在开展活动过程中，史志办党支部紧紧
主题党日活动总结 本文内容：
开展“喜迎十九大、党员当先锋”主题党日活动总结
今年是中国共产党建党96周年，也是十九大召开之年，更是深入推进党的建设的重要一年，为进一步增强党组织生活的吸引力，充分发挥基层党组织在党员教育、管理和服务中的作用，开展“喜迎十九大、党员当先锋”主题党日活动。
一、总体情况
在开展活动过程中，史志办党支部紧紧围绕党的“两学一做”活动要求，紧扣主题、结合实际、突出特色，采取理论研讨、下基层走访慰问、志愿公益服务和参观学习等多种形式开展活动，取得一定成效。
二、活动形式
1、开展党员讨论活动
每周组织全体党员开展讨论活动，以“迎接十九大、党员当先锋”主题党日活动为契机，结合“两学一做，四讲四有”等进行广泛讨论列出了合格党员标准和不合党员的表现，播放了党风廉政教育片，观看了党的历史纪录片。党支部书记孟霞为大家上党课，并以“遵纪守法、廉洁自律”为主题的廉政党课。
2、深入基层了解情况。
全体党员深入基层一线，深入到驻村连户的杨柳镇田家庄村静心倾听基层声音，了解基层群众想法，真正做到换位思考，实现联系服务群众“零距离”，帮助群众解决生产生活中遇到的困难。
3、组织党员参观学习。
组织全体党员到徐州淮海战役纪念馆参观学习，接受红色教育，感受党的历史，瞻仰了革命烈士的丰功伟绩，聆听了他们的先进事迹，观看了珍贵的历史图片资料，感受到了革命烈士英勇杀敌和老百姓无私奉献的革命精神，受到了一次深刻的革命历史教育，有力提升了党员的爱国热情，必将推动“两学一做”活动深入开展。
“喜迎十九大、党员当先锋”主题党日活动，参与其中的党员都积极投入，热情极高，既引导党员坚定理想信念、增强自身素质、发挥模范带头作用，又能针对工作中的具体问题，找到了切实可行的解决方案，增强党组织的凝聚力、创造力。史志办党支部将继续以为基层党组织活动平台，以创先争优为抓手，发挥基层党组织的战斗堡垒作用，同心协力，唱响主题党日活动，为建设大而强、富而美的新泗水贡献力量。
县史志办
2017年9月29日
篇3：生物教师年度总结报告
生物教师年度总结报告 本文关键词：总结报告，生物，年度，教师
生物教师年度总结报告 本文简介：生物教师年度总结报告本学年我担任七年级生物学的教学工作和档案管理工作，这一学年来我认真执行学校教育教学工作计划，转变思想，积极探索，改革教学，把新课程标准的新思想、新理念和生物课堂教学的新思路、新设想结合起来，转变思想，积极探索，改革教学方法，与新课程共成长。在档案管理工作中能认真的完成本职工作，按
生物教师年度总结报告 本文内容：
生物教师年度总结报告
本学年我担任七年级生物学的教学工作和档案管理工作，这一学年来我认真执行学校教育教学工作计划，转变思想，积极探索，改革教学，把新课程标准的新思想、新理念和生物课堂教学的新思路、新设想结合起来，转变思想，积极探索，改革教学方法，与新课程共成长。在档案管理工作中能认真的完成本职工作，按时完成上级领导下派的各项任务，总结如下：
首先我谈谈担任初七生物教学工作的总结：
一，加强学习不断提高思想和业务机能素质。
本学年我是第一次担任初七生物工作的，对很多生物工作的认识了解做的准备工作不是很够，但是上级领导对我的工作能力的信任，初七的生物工作我要完成的更好，俗话说“学海无涯，教无止境”，只有不断的学习，才能让生物学科有更好的青春和活力，我一直在课余时间积极学习，认真掌握初七生物知识，认真结合第八次课程的改革，明确学习的重点以及新课程的标准跟理论规划。另外我还通过各种生物方面的书籍，网络认真学习了生物新课程的执行标准。以及相关的如《教师怎样与新课程同行》等各种相关的书记和，让我在工作中不断成长，树立了先进的教学理念，为了更好的担任教学工作，明确努力的方向，还通过各种学习活动，如网络听课，公开课等让自己在教学方面不断的提高。让自己的知识不断累计，丰富了自己的知识量，为以后的教学工作做好更好的准备。
二，让生物课程走入课堂。
如何教好初七生物，如何贯彻《国家生物课程标准》对生物的教学内容，教学方式，教学评估教育价值观等多方面都提出了许多新的要求。为此，我认真学习新课程标准的基本理念，设计思路，课程目标，内容标准及新课程教材。使自己教育教学水平跃上了一个新的台阶。
三：如何通过生物课程让师生之间互动共同学习。
作为一名数学专业的老师，在以前的工作实践中，我掌握很多的教学方法，能很好的和学生交流互动。同样我以饱满的热情来接管生物课程的工作。为了展现自己全面发展的能力，我毅然接受了上级领导的考验。在以往的数学教学工作中，我能充分发展学生情感和态度价值观，使老师跟同学之间成为朋友进行互动发展。充分而积极的利用各种教学资源，改变教学方法，学法。从而获得了很多宝贵的教学经验，同样利用在生物课程中得到了明显的验证。在备课时，真多本班的实际情况，有针对性的精心备课，撰写教案。课后通过课堂的切身体会或疏漏，及时的记录学生在学习中的优越性和困惑性。通过这样的教学方式，我汲取了大量的教学经验，开发学生自主性学习，在本学年的第一学期，本班的生物平均成绩名列全县第一，可见我的教学方法得到了很好的验证，得到了学生的肯定。在不断的思考探索中，全心的在学生中付出得到了成绩的回报，作为一名以数学专业毕业的老师，为自己的付出的工作得到如此的回报，感到无比的骄傲。
教育教学是我们身为教师的首要任务，本学年我努力讲新课程的理念应用的课堂实践教学中，活用新教材，实践新理念，力求让生物课更具特色，形成独具的风格以及教学模式，很好的提高了生物教学质量，是上级领导跟同事有目共睹的。
在担任初七生物课程时，我坚持切实做好认真教学，结合本班的实际，灵活的上好每堂课，真正做好课堂内容当堂完成。课后对学生的作业进行细致的批改，通过各种实践实验课使学生对生物课程产生浓郁的兴趣，同时也是为了以后各种教学累计经验，不让上级领导跟同事失望。另外还通过授课后根据得失即使写些教后感。及时跟本班的班主任进行沟通，了解每个学生，因人而异很好的改进教学方法突破学法，针对一些旧教材内容的陈旧，单一，脱离学生的实际问题。我积极对初七的课程进行开发跟设计。通过系统性的，阶段性的激发学生的热情促进学生的全面发展，对学生的学习进行及时的平价，关注和技能理解掌握，更关注学生的情感与学习态度形成的和发展，既能发现学生的学习成果还能有花和发展他们的学习。
四：在教育工作中能及时发现自己工作中的不足。
首先体现在生物新课程标准的学习不够深入，在新课程的实践中思考还不够多，不能很好的针对性的对教学方面的想法跟问题记录下来，进行很好的反思。
其次，在教教研方面本学年加大了学习力度，虽然认真的研读了一些有关教研方面的书籍，但是在实践中不能应用的到位，没达到自己心目中理想的目标。
最后，在生物教学中很多有特色有创意的东西好不够多，本想设置生物兴趣小组，但是由于各种原因没在现实中落实，在今后的教学中，我要多找出各个学科的兴趣，让学生学的有兴趣，为生物学的做出贡献，一份耕耘，一份收获，在学海无涯的知识世界工作中苦乐相伴。我会本着“勤学、善思、实干”的准则，一如既往，再接再厉，把工作搞得更好。
接下来我在谈谈XX年我对学校档案工作的年度总结。
XX年，在学校上级领导有关负责人的正确指导与帮助下，坚持国家对教育档案的相关精神，坚持教育工作的各项方针和制度，以教师工作行为守则严格要求自己，刻苦专研业务，熟练掌握本岗位的管理办法和工作规程。将一年来的主要工作汇报如下：
一，思想政治方面
能够认真学习马列主义毛泽东思想以及邓小平理论和和国家教委的重要思想，深刻领会国家教委的精神和档案的工作原则。与教育档案方针原则保持一致，坚持实事求是，坚持原则，遵纪守法，没出现危机违章行为。按照相关的意见改变工作方法，提高自己的学做业务水平。
二：认真完成本职工作以及领导交办的各项工作任务。
加强对文件收发与管理，首先加强对外来文件的登记与管理。对上级教委的每份文件即使送领导传阅，然后按照领导的批示再对文件进行合理的上传下达，基本杜绝了处理上的积压，延时，失误等现象发生。对各个学组的学习文件进行认证登记编号。对文件进行妥善的保管，分门别类。为以后的档案工作做好准备。促进档案管理与达标，根据《档案法》和《档案管理条例》，紧密的结合教育档案的归档范围及保管期限的规定，使档案工作基本实现了制度化和规范化，为了提高档案管理的自身价值和促进全面教育系统的档案管理达标升级工作起到了积极的促进作用。特别是上级教委对本校的检查工作时，我能很好的完成本校领导交给的任务。积极配合学校领导抓好日常事物性的工作，能够很好的衔接上下级的工作与沟通，还能内外联系工作，很好的保证了学校的日常工作，尽到了自己的责任。
三：存在的问题及未来的工作打算
首先，我是理科专业毕业的，对档案功底不够扎实，每周担任两节生物课，对档案管理的问题分析的不够彻底，独立解决问题的能力较差，对档案的很多专业知识欠缺。对文稿的起草还要进一步提高。我将进一步的学习，在不耽误生物课程的担任同时，很好的完成档案工作，努力提高自己的政治素质学习水平跟工作能力。尽职尽责，圆满完成各项上级领导下达的任务，俗话说：“能者多劳”，我会为教育事业做出自己应做的贡献。
综上所述，这是本年度本人对七年级生物课程和档案工作的总结。首先感谢校领导的栽培，还要感谢平时对我工作支持的很多同事，在未来的教育工作中，我会脚踏实地的走好每一步，希望能在本专业的应用特长教学，虽然我现在做的不是本专业的工作，但是我的成绩没让领导跟同事失望过，如果我在本专业内进行教学，我想会发挥的更好，恳请校领导给我一次机会，让我在数学教学领域有更好的发展。在今后的工作中我会迅速的成长，不会让校领导失望，做出更好的成绩来感谢校领导对我的厚爱。