1、认识存在偏差：
（1）把校本教研等同于课题研究，认为校本教研就是课题研究，搞校本教研就是搞课题研究。在此认识下，一些学校将校本教研视作学校装璜门面的旗帜，把校本教研的重点放在比课题数量、级别上，追求轰动效应，而不顾本校是否有承担该课题的能力及课题是否解决本校的现实问题。平常的研究口号喊得震天响，研究工作基本不落实，上级部门来检查时搞得热热闹闹，平时则不闻不问。另一些学校则对校本教研敬而远之，采取观望的态度等、靠、要，等别人拿出好的经验来自己依葫芦画瓢，靠教育行政部门、教研部门的督促，才勉强开展应付式的教研活动，向有关研究人员要课题，要方案。
（2）把校本教研局限于学校现成的教研形式与内容。认为校本教研不过是专家在课改过程中，为了强化学校的教研活动，提升学校教研活动的理论认识，针对学校在教研活动中的已有的经验和做法提出的新名词，换汤不换药，没有实质性的新意。他们认为，传统的学校教研活动与教学工作是两张皮，不能直接解决教师在课改过程中遇到的实质性问题，因此对于校本教研没有投入的热情。学校经常以当时的“中心工作”冲击学科教研组的教研活动；教师则把校本教研当作教学工作之余的额外负担，常常以要备课、批改作业、要管学生为借口逃避教研活动。即使参加教研活动，也总是处于被动状态组长叫干什么就干什么，组长讲什么就应答什么，缺乏研究激情。
2、活动缺乏新意
绝大多数学校所开展的教研活动，其基本形式大致是学校讲座、学科教研组内交流活动及讲课
