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蛋白质CD光谱定性解析_总结

蛋白质CD光谱定性解析_总结 本文关键词:光谱,定性,蛋白质,解析,CD

蛋白质CD光谱定性解析_总结 本文简介:蛋白质的圆二色性(1)由氨基酸通过肽键连接而成;(2)光学活性基团:肽键、芳香氨基酸残基、二硫桥键;(3)蛋白质有多个结构层次,相同的氨基酸序列,因蛋白质的折叠结构不同,基团的光学活性受到影响。蛋白质的圆二色特征(1)光学活性基团及折叠结构;(2)250nm以下的光谱区,肽键的电子跃迁引起;(3)2

蛋白质CD光谱定性解析_总结 本文内容:

蛋白质的圆二色性

(1)由氨基酸通过肽键连接而成;

(2)光学活性基团:肽键、芳香氨基酸残基、二硫桥键;

(3)蛋白质有多个结构层次,相同的氨基酸序列,因蛋白质的折叠结构不同,基团的光学活性受到影响。

蛋白质的圆二色特征

(1)光学活性基团及折叠结构;

(2)250nm以下的光谱区,肽键的电子跃迁引起;

(3)250~300nm光谱区,侧链芳香基团的电子跃迁引起;

(4)300~700nm光谱区,蛋白质辅基等外在生色基团引起。

蛋白质CD光谱的波长范围:远紫外区(185-245nm)、近紫外区(245-320nm)

分子构象

电子跃迁

形式

极值的波长

[θ]*103

Deg.cm2/dmol

α-螺旋

(α-helix)

n→π﹡

π→π﹡

221~222nm(-)

207~210nm(-)

191nm(+)

-38~-40

-36~-40

72~86

β-折叠

(β-sheet)

n→π﹡

π→π﹡

217~218nm(-)

195~197nm(+)

-19~-21

28~42

β-转角

(β-turn)

n→π﹡

π→π﹡

227nm(-)

200~205nm(+)

192.5(-)强

无规卷曲

(random

coil)

π→π﹡

230nm(-)

215~218nm

(+)

195~202nm(-)强

-1.6

1~2

-25~-50

圆二色谱法分析多肽二级结构

圆二色谱是一种特殊的吸收谱,它通过测量蛋白质等生物大分子的圆二色光谱,从而得到生物大分子的二级结构,简单、快捷,广泛应用在蛋白质折叠,蛋白质构象研究,酶动力学等领域。

圆二色谱紫外区段(190-240nm),主要生色团是肽链,这一波长范围的CD谱包含了生物大分子主链构象的信息。α-螺旋构象的CD谱在222nm、208nm处呈负峰,在190nm附近有一正峰。β-折叠构象的CD谱,在217-218nm处有一负峰,在195-198nm处有一强的正峰。无规则卷曲构象的CD谱在198nm附近有一负峰,在220nm附近有一小而宽的正峰。

蛋白浓度与使用的光径厚度和测量区域有一定关系,对于测量远紫外区德氨基酸残基微环境的蛋白而言,浓度范围在0.1~1.0mg/ml,则光径可选择在0.1~0.2cm之间,溶液体积则在200~500ul。而测量近紫外区的蛋白质三级结构,所需浓度要至少比远紫外区的浓10倍方能检测到有效信号,且一般光径的选择均在0.2~1.0cm,相应的体积也需增加至1~2mL

缓冲液可选50~100mmol

trs-HCl、PBS等,尽量除去EDTA。

远紫外

近紫外

二硫键一般都是不对称的,它在圆二色性光谱上,于195-200nm和250-260处有谱峰

色氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸残基的侧链其谱峰在230-310nm之间,色氨酸残基侧链的谱峰一般集中在290-

310nm之间,但有时也会向短波长方向移动从而与酪氨酸残基侧链的谱峰重叠

在250-260nm之间,苯环的谱峰又与二流键的谱峰重叠

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