为鼓励团队协作、跨学科联合，激励科研人员承担国家重大、重点项目，也为方便各科研单元顺利开展工作，结合新科研管理信息系统的运行，经研究决定，对于科研人员承担的国家、省部级重大、重点科研项目，可根据项目实施启动时的实际情况，允许校内合作经费进行分割。
特作如下管理规定：
因研究工作确需经费分割使用的项目，原则上规定纵向课题总经费≥30万元人民币或横向课题总经费≥50万元人民币的项目，经所在院系同意方可办理相关手续。
除合同(任务书)中已规定设立子课题，并明确各子课题项目负责人职责的项目外，项目负责人根据需要可在校内设立若干子课题，在经费分割前，必须分别与各合作人签定校内合作协议(双方签字、所在院系盖章)。协议内容包括：项目负责人根据预算明确合作人经费使用额度与使用范围，承担研究工作内容、知识产权归属等。
项目负责人负责对整个项目的组织与协调，对项目按合同(任务书)完成负责。
在办理项目入帐时，由项目负责人填写项目立项信息表，经审核后，由科技处经费管理人员办理项目与子课题经费本。经费按项目与子课题负责人所在学院(系)进行统计。子课题经费支出汇总至项目进行决算。
合作经费分割需要考虑项目预算书的总预算安排，确保项目经费的使用符合国家相关规定，以便结题时经费决算合理规范。
子课题设立后不纳入晋升、奖励范畴，研究人员排名按项目合同(任务书)或立项信息表中顺序确定。
东南大学科技处